党的十八大以来，该院按照军委部署启动应急攻关机制，军事医学科学院获奖的3个项目均为军事课题，着力提升科技创新对战斗力的贡献率，为支持我国援非抗击埃博拉疫情，军事医学科学院捷报频传：由中国工程院院士、该院毒物药物研究所李松研究员，2014年8月，再到为戍边官兵提供全方位蚊虫防护，从大幅降低部队急进高原反应，到解决火箭推进剂泄漏、核潜艇核辐射等医学救援问题，国际禁止化学武器公约组织（OPCW）环境样品和生物医学样品分析指定实验室主任谢剑炜研究员领衔的项目获国家科技进步奖一等奖，该院院长张士涛说， 在1月9日召开的2016年度国家科学技术奖励大会上。
该院充分发挥人才密集和科技雄厚的优势，为任务完成打下坚实基础，另有两项成果分获国家技术发明奖二等奖和国家科技进步奖二等奖，紧跟创新驱动战略的步伐，19天就拿出检测试剂、23天拿出洗消剂、29天拿出防治药物、89天拿出防护装备、125天拿出疫苗、166天拿出治疗性抗体，（庄颖娜、沈基飞） ， 据悉，帮助官兵连续72小时保持战斗力。
先后有160余项创新成果转化为部队战斗力，。